Alibunar se nalazi u jugoistočnom delu Vojvodine, u neposrednoj blizini auto-puta E70. Opština se prostire na severozapadnom delu Deliblatske peščare, dok severoistočnu granicu čini Dunav-Tisa-Dunav kanal. Ovaj deo Vojvodine poznat je po vinskom turizmu, a među brojnim aktivnim vinarijama najpoznatija je Banatski Biser.
Alibunar je nastao tokom turske vladavine. Ime se prvi put pominje 1695. godine kao Ali Binar. Ime potiče od turskog toponima Ali Binar, što znači „Ali-ev bunar“ (Ali-ev izvor).